MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 5078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015597	G	6	6	119	124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015597	GCCC	2	8	134	141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015597	CGG	2	6	144	149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015597	GCG	2	6	166	171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015597	TTC	2	6	189	194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015597	GGC	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015597	GGA	2	6	262	267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015597	GCC	2	6	352	357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321233
9	NC_015597	TGC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321233
10	NC_015597	CCG	2	6	398	403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321233
11	NC_015597	ACG	3	9	502	510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015597	TC	3	6	610	615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015597	GC	3	6	625	630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015597	AACG	2	8	711	718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015597	CCGCC	2	10	763	772	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_015597	CAG	2	6	795	800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015597	GAG	2	6	808	813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015597	CAA	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321234
19	NC_015597	GAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321234
20	NC_015597	CCA	3	9	1126	1134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321234
21	NC_015597	CGT	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321234
22	NC_015597	TCG	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321235
23	NC_015597	AAAG	2	8	1284	1291	75 %	0 %	25 %	0 %	334321235
24	NC_015597	CGTG	2	8	1320	1327	0 %	25 %	50 %	25 %	334321235
25	NC_015597	CAG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321235
26	NC_015597	GAC	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321235
27	NC_015597	AGA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015597	ATT	2	6	1667	1672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334321236
29	NC_015597	CTG	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
30	NC_015597	ACCG	2	8	1695	1702	25 %	0 %	25 %	50 %	334321236
31	NC_015597	GATC	2	8	1855	1862	25 %	25 %	25 %	25 %	334321236
32	NC_015597	CCG	2	6	1865	1870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
33	NC_015597	CGC	2	6	1925	1930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
34	NC_015597	CGGC	2	8	1958	1965	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
35	NC_015597	GACA	2	8	1971	1978	50 %	0 %	25 %	25 %	334321236
36	NC_015597	GTC	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
37	NC_015597	GATG	2	8	2019	2026	25 %	25 %	50 %	0 %	334321236
38	NC_015597	GA	3	6	2029	2034	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
39	NC_015597	GGAGGG	2	12	2043	2054	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	334321236
40	NC_015597	GAGGGG	4	24	2055	2078	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	334321236
41	NC_015597	CGG	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321236
42	NC_015597	GTT	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321236
43	NC_015597	GCC	2	6	2157	2162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
44	NC_015597	CAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
45	NC_015597	GCA	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
46	NC_015597	CCG	2	6	2394	2399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321236
47	NC_015597	GA	3	6	2418	2423	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
48	NC_015597	TCG	2	6	2443	2448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
49	NC_015597	CGGC	2	8	2453	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
50	NC_015597	AGC	3	9	2524	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
51	NC_015597	AGC	2	6	2682	2687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321236
52	NC_015597	TCG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321236
53	NC_015597	CGG	2	6	2722	2727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321236
54	NC_015597	GC	3	6	2747	2752	0 %	0 %	50 %	50 %	334321236
55	NC_015597	GA	3	6	2767	2772	50 %	0 %	50 %	0 %	334321236
56	NC_015597	TTC	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321236
57	NC_015597	CGG	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015597	TCC	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015597	ACG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015597	CACC	2	8	3118	3125	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_015597	TGC	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015597	CCG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015597	GAG	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015597	GCTC	2	8	3289	3296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015597	GGAAG	2	10	3308	3317	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015597	GAC	3	9	3321	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015597	A	6	6	3330	3335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015597	GCC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015597	GAT	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015597	ATG	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015597	GGA	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015597	GCG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015597	CGG	2	6	3524	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015597	TGC	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015597	TCG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015597	TGC	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015597	TTG	2	6	3604	3609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015597	GCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015597	GCT	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015597	GCT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015597	GCC	2	6	3754	3759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015597	GGA	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015597	CGC	2	6	3923	3928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015597	GGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015597	GGGAGG	2	12	3975	3986	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015597	AGG	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015597	AGC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015597	AGC	3	9	4099	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015597	TCA	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015597	GTT	2	6	4142	4147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015597	GTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015597	CGA	2	6	4207	4212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015597	CGG	2	6	4236	4241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015597	GTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015597	ACC	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015597	GGT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015597	CGT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015597	GGTCC	2	10	4590	4599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015597	GTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015597	TTGT	2	8	4728	4735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015597	GAT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015597	ATG	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015597	TCT	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015597	ATGGC	2	10	4994	5003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015597	ACA	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015597	AGA	2	6	5105	5110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015597	GAC	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015597	GGCC	2	8	5158	5165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015597	GCC	2	6	5282	5287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015597	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321237
111	NC_015597	CTC	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321237
112	NC_015597	ATC	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321237
113	NC_015597	CGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321237
114	NC_015597	GACG	2	8	5448	5455	25 %	0 %	50 %	25 %	334321237
115	NC_015597	GC	3	6	5491	5496	0 %	0 %	50 %	50 %	334321237
116	NC_015597	TCG	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321237
117	NC_015597	ACG	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321237
118	NC_015597	AAG	2	6	5546	5551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321237
119	NC_015597	GGC	2	6	5630	5635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321237
120	NC_015597	CGC	2	6	5733	5738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321237
121	NC_015597	TTC	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321237
122	NC_015597	TGC	3	9	5804	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321238
123	NC_015597	AG	3	6	5889	5894	50 %	0 %	50 %	0 %	334321238
124	NC_015597	GAC	2	6	5932	5937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321238
125	NC_015597	T	6	6	5941	5946	0 %	100 %	0 %	0 %	334321238
126	NC_015597	AGT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334321238
127	NC_015597	AGC	2	6	5956	5961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321238
128	NC_015597	CGAT	2	8	5976	5983	25 %	25 %	25 %	25 %	334321238
129	NC_015597	GCC	2	6	5996	6001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321238
130	NC_015597	CGGTTG	2	12	6018	6029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334321238
131	NC_015597	TTCC	2	8	6057	6064	0 %	50 %	0 %	50 %	334321238
132	NC_015597	GCG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321238
133	NC_015597	TCT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321238
134	NC_015597	T	9	9	6156	6164	0 %	100 %	0 %	0 %	334321238
135	NC_015597	CCA	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321238
136	NC_015597	TCG	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321238
137	NC_015597	TG	3	6	6275	6280	0 %	50 %	50 %	0 %	334321238
138	NC_015597	CTT	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321238
139	NC_015597	AAG	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321238
140	NC_015597	CGGA	2	8	6337	6344	25 %	0 %	50 %	25 %	334321238
141	NC_015597	TTC	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321238
142	NC_015597	ACC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321238
143	NC_015597	AGC	2	6	6500	6505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321238
144	NC_015597	TTG	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321238
145	NC_015597	AGG	2	6	6618	6623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334321238
146	NC_015597	GGATA	2	10	6946	6955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015597	CGA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015597	GTTC	2	8	6968	6975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015597	TCG	2	6	6998	7003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015597	GGCT	2	8	7170	7177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015597	CTG	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015597	CGGC	2	8	7343	7350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015597	CTT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015597	GTC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015597	CGC	2	6	7519	7524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_015597	GAT	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015597	CGA	2	6	7636	7641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015597	ACG	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015597	CGC	2	6	7726	7731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_015597	CGC	2	6	7746	7751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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162	NC_015597	CGA	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015597	AAC	2	6	7883	7888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015597	GCC	2	6	8038	8043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_015597	CCG	2	6	8048	8053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_015597	GCC	2	6	8070	8075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_015597	TGG	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015597	ACC	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_015597	GGCAC	2	10	8229	8238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
170	NC_015597	A	6	6	8306	8311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015597	GTCC	2	8	8334	8341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_015597	CGA	2	6	8372	8377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_015597	CTCGAT	2	12	8382	8393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_015597	CGA	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015597	TGC	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_015597	ATG	2	6	8485	8490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015597	TGC	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_015597	GTG	3	9	8562	8570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_015597	CGT	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_015597	GTC	2	6	8669	8674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_015597	CGGG	2	8	8721	8728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
184	NC_015597	GCG	2	6	8820	8825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015597	CGT	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_015597	AAC	2	6	8944	8949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_015597	TCA	2	6	14096	14101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_015597	ACT	2	6	14198	14203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_015597	CTC	2	6	14327	14332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_015597	TCT	2	6	14522	14527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_015597	CAT	2	6	14553	14558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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